หมู่บ้านญี่ปุ่นตั้งอยู่ด้านใต้ของเกาะเมือง ซึ่งเป็นที่ตั้งชุมชนชาวต่างชาติที่เดินทางมาค้าขายที่กรุงศรีอยุธยา ไม่ว่าจะเป็นหมู่บ้านโปรตุเกส หมู่บ้านฮอลันดา หมู่บ้านอังกฤษ โดยต่างได้รับพระราชทานที่ดินตั้งชุมชนบ้านเรือนอยู่บริเวณเดียวกัน ชาวญี่ปุ่นเข้ามาในกรุงศรีอยุธยาตั้งแต่สมัยสมเด็จพระมหาจักรพรรดิ แ
